В библиотеке Genome Altai Plants находятся более трёх тысяч образцов и свыше 150 видов растений. Эта база данных способствует развитию методов проточной цитометрии и значительно снижает затраты на исследования.
Библиотеку стандартов оценки относительного и абсолютного содержания ДНК в растениях создали специалисты из Алтайского государственного университета. Куратор рабочей группы учёных Алексей Ваганов сообщил ТАСС, что метод проточной цитометрии экономичнее других способов оценки содержания ДНК и анализа плоидности. Он подчеркнул, что данный способ поможет эффективнее проводить высокопроизводительные исследования.
«Эта библиотека стандартов содержит информацию о эталонных организмах, от которых мы отталкиваемся для исследования размера генома. Три года мы накапливали базу данных геномов растений, преимущественно с Алтая. А теперь, на четвёртом этапе, мы, исходя из накопленного массива, разработали линейку стандартов для исследования растений в широком спектре размеров генома. Мы сосредоточились на полезных растениях: на группах лекарственных, пищевых, кормовых, витаминосодержащих, то есть хозяйственно-ценных растениях», — отметил учёный.
Кроме того, по словам Алексея Ваганова, этот способ исследования превосходит денситометрию или микроскопию, поскольку менее требователен к образцам и более оперативен.
Михаил Скапцов, участник рабочей группы, добавил, что такой метод используется исследовательскими лабораториями для решения прикладных задач селекции видов культур и растений. Он позволяет оперативно определять отклонения в геноме и находить промежуточные формы. Поэтому алтайская база данных находится в открытом доступе.
Справка
Проточная цитометрия используется учёными для анализа физических и химических характеристик клеток или частиц. В данном случае оценивается размер генома в пикограммах. Таким образом, учёные могут определить, насколько большой геном у исследуемого организма.
