Летом 1854 года у барнаульского берега причалил первый речной пароход «Ермак», купца Хамикова, пришедший с низовьев Оби с грузом товаров. С этого времени начался отсчёт времени пароходного судоходства на Алтае.
При отсутствии железнодорожного сообщения водный транспорт имел большое значение для развития городов и торговли. К 1885 году речной флот Оби насчитывал 114 пароходов. От Барнаула до Томска пароходы с баржами шли пять суток, до Тюмени — две недели. Были построены пристани в Бийске, Камне, Усть-Чарыше. К концу XVIII века на Алтае собирали хорошие урожаи зерна и вывозили его, в основном, через Тюмень в Европейскую часть России. Так, в 1891 году с пристаней Оби на Алтае и Тюмени было отправлено восемь с половиной миллионов пудов зерна. К 1910 году самой мощной флотилией владела Евдокия Ивановна Мельникова. Родом из Вологодской губернии, мещанка. Выйдя замуж за Виссариона Мельникова, стала купчихой 2-й гильдии. Рано овдовев, она в 1893 году самостоятельно основала пароходную компанию. Мельникова обладала властным, вернее сказать, жёстким характером и была очень предприимчива. Формально пароходной компанией владел её сын Александр, но на деле всё было в распоряжении матери. К 1910 году по рекам Обь-Иртышского бассейна ходили 10 пароходов и 6 барж, принадлежащих компании. Пароходы того времени в основном занимались грузоперевозками. Евдокия Ивановна стала первой, кто организовал пассажироперевозки по Оби на пароходе «Кормилец» соответствующий всем требованиям комфорта того времени. На нём было электрическое освещение, отопление, доставка обедов в каюты, библиотека, музыкальный салон.
После смерти Евдокии Мельниковой, сын продал пароходство Западно-Сибирскому товариществу, а в 1921 году трагически погиб её любимый пароход «Кормилец». В районе города Новониколаевска он врезался в стойку железнодорожного моста и затонул, унося жизни 200 человек.
Пароходы нуждаются в техническом обслуживании, ремонте, что как правило проводится в долгие зимние месяцы. Речные протоки около Барнаула стали центром концентрации речников и вскоре здесь вырос посёлок Бобровский затон. Жилые бараки ремонтных мастерских не соответствовали даже скромным гигиеническим требованиям. Скученность сотен людей, особенно в зимние месяцы, приводили к возникновению инфекционных заболеваний, завшивленности, при полном отсутствии медицинской помощи.
В годы революции и последующей гражданской войны, отряд красногвардейцев водников сыграл большую роль в установлении Советской власти в Барнауле. По окончании гражданской войны коммерческие пароходства, судоверфь, ремонтные мастерские, склады были реквизированы и в 1923 году было создано Западно-Сибирское речное пароходство, в состав которого вошло и Барнаульское, стали улучшаться условия жизни речников. В этом же году в Бобровском затоне попытались открыть поликлинику со стационаром на три койки, но в связи с отсутствием медперсонала она практически не работала. В 1924 году больница работников водного транспорта была размещена в двухэтажном здании по улице Чехова, где ранее находилась краевая малярийная станция, переехавшая в здание по адресу улица Партизанская, 114. 1924 год — дата рождения больницы водного транспорта.
В 1928 году, в связи с необходимостью расширения медицинской помощи для работников водного транспорта, по приказу АлтГуп Здравотдела, больница была размещена в здании на пересечении улиц 2-я Луговая и переулок Мостовой, сегодня улица Чехова, 12.
По архивным данным, первоначально этот жилой дом и склады принадлежали купцу Д. А. Хлыстову и находились в аренде у датской торговой фирмы «Сибирская компания», которая занималась скупкой у населения масла и продажей земледельческих машин. Вследствие пожара в ночь с 22 на 23 июля 1914 года все строения на улице были уничтожены, пострадало и это здание. Последнее было восстановлено в 1916 году и в нем до 1920 года по-прежнему размещалась «Сибирская компания». В 1920 году здание было передано Барнаульскому отделению Рабоче-Крестьянской инспекции водного отдела Сибирского округа путей сообщения, а в 1924 году каменный 2-х этажный дом заняла контора акционерного общества «Хлебопродукт». В 1928 году в здании разместились Барнаульская амбулатория №8 и Барнаульская больница №4 водного транспорта. Здание, в котором первично располагалась больница водников более не существует.
В больнице был развернут стационар на 25 коек и одну койку в изоляторе, а также операционная. Медицинская помощь оказывалась работникам водного транспорта, а также всем жителям старой части города Барнаула.
Отопление больницы было печным. В ванной комнате, где мылись больные, стоял титан, который также отапливался дровами. Водопровода и канализации в больнице не было. Воду привозили в бочке на лошади. Туалет был на улице. В 1930-е годы была сделана пристройка (котельная), и больницу стали отапливать углем, в 1954 году установлено центральное водяное отопление. В деревянной пристройке находилась прачечная, где больничное белье стирали вручную. На втором этаже здания была застекленная веранда. В ней зимой сушили бельё, а летом отдыхали больные, в теплое время года размещалась столовая для больных. Зимой пациентов кормили в коридоре больницы.
Операционная освещалась обыкновенной электрической лампочкой, автоклав работал при помощи примуса. Когда отключали электроэнергию, а это было довольно часто, тогда экстренные операции проводили при свете керосиновой лампы «Малыш». Многие медикаменты, в том числе и стерильные, готовились в больничной аптеке.
Поликлинический приём осуществляли врачи: терапевты, хирурги, неврологи, гинекологи и дермато-венерологи.
Врачом-терапевтом работала Заварзина Екатерина Григорьевна, хирургом Демидов Семён Николаевич, главной медицинской сестрой Кудрина Елена Николаевна.
В сентябре 1950 года приказом министра здравоохранения СССР №738 учреждение было переименовано в Барнаульско-линейную больницу водного транспорта.
С 1937 по 1964 годы больницу возглавлял Семён Николаевич Демидов, с перерывом (1941 – 1945 гг.) был на фронте. Ушёл на пенсию в 1964 году, но продолжал трудиться до 1967 года.
Восемь сотрудников больницы участвовали в Великой Отечественной войне и были награждены орденами и медалями.
Один из них врач-рентгенолог Кострыкин Александр Иванович, заслуженный врач РСФСР, полковник медицинской службы в отставке. Награжден орденом «Красной Звезды», медалью «За победу над Германией в Великой отечественной войне 1941–1945 гг.».
С 1967 по 1994 годы главным врачом был врач-хирург Синкин Евгений Иванович. Главным врачам Семёну Демидову и Евгению Синкину посвящены стихи:
Для больницы вы многое сделали,
Не жалея здоровья и сил.
Ваши души — голуби белые
Господь в синее небо пустил.
Вы летите над Водной больницей
Над рекой парите родной
Мы дела ваши помним и лица
Да воздастся и нам сторицей
По заслугам в юдоли земной.
Здание больницы было реконструировано в 1956 году, с целью расширения коечного фонда, за счёт кирпичной пристройки. В результате чего коечный фонд больницы составил 35 коек, по профилям: неврология, хирургия, терапия, гинекология. В период с 1966 до 1970 года была сделана вторая кирпичная пристройка, за счет чего больница получила 5 новых палат, ординаторскую, столовую для больных, коечный фонд увеличился до 65 коек. Из них 45 терапевтических коек, 15 неврологических и 5 гинекологических.
В 1984 году в поликлинике начали приём окулисты, стоматологи и отоларингологи, появились рентгенодиагностический кабинет, кабинет функциональной диагностики, клинико-биохимическая лаборатория.
В период с 1988 по 1994 годы — заведующей поликлиникой работала Сальникова Светлана Яковлевна. С 1995 по 2008 год она являлась главным врачом больницы водного транспорта, с 2008 по 2022 год заместителем главного врача по клинико-экспертной работе. Оснастила больницу новым лечебно-диагностическим оборудованием, сформировала кадровый состав больницы. С 2002 года — Заслуженный врач Российской Федерации. Награждена медалью за мужество, за участие в ликвидации последствий землетрясения в городе Спитак.
В 1995 году Барнаульская линейная больница водного транспорта перешла в федеральное подчинение и стала называться Алтайская больница ФГУ СОМЦ Росздрава.
В 2008 году больница перешла в ведомство Федерального медико-биологического агентства и стала называться Филиал №1— Алтайская больница ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России. Обслуживала прикрепленное население, сотрудников государственной и муниципальной службы города Барнаула и Алтайского края, членов их семей, силовых структур, в частности МЧС России по Алтайскому краю. Количество прикрепленного контингента составляло 28 000 человек. Активно проводились периодические медицинские осмотры, работал круглосуточный неврологический стационар на 40 коек. Медицинский персонал принимал участие в учениях по ликвидации последствий ЧС совместно с ГО ЧС по Алтайскому краю.
В 2014 году, здание больницы было передано КГБУЗ «Краевая клиническая больница» и в ней открыта поликлиника №2.
С 2014 года по настоящее время поликлиникой руководит заместитель главного врача по поликлинике №2 КГБУЗ «Краевая клиническая больница», врач высшей медицинской категории Наталья Синяговская. Старшая медицинская сестра — Дарья Соколова, медицинская сестра высшей квалификационной категории. Заведующая дневным стационаром, врач-невролог высшей медицинской категории Елена Жарикова.
На следующий 2025 год коллективу поликлиники предстоит встретить еще один юбилей, посвященный 75-летию КГБУЗ «Краевая клиническая больница» в структуре которой он теперь трудится.
